Siberian Journal of Life Sciences and AgricultureSiberian Journal of Life Sciences and AgricultureSiberian Journal of Life Sciences and Agriculture2658-66492658-6657Science and Innovation Center Publishing House44282810.12731/2658-6649-2026-18-1-1431DKFNZMSoil Fertility and Plant ProtectionЗемледелие и защита растенийResearch ArticleFirst report on the pathogen Fusarium Curvatum L. Lombard & Crous of the apple root grain mycopathos complex in RussiaПервое сообщение о патогене Fusarium Curvatum L. Lombard & Crous микопатокомплекса корневой гнили яблони в Россииhttps://orcid.org/0000-0002-9713-038357558038700K-8646-20188684-6159АстапчукИрина ЛеонидовнаAstapchukIrina L.
Россия

Ph.D. in Biology, Research Associate at the Laboratory for Biotechnological Control of Phytopathogens and Phytophages; Head of the Phytopathology Laboratory at the Biotechnology Center

канд. биол. наук, научный сотрудник лаборатории биотехнологического контроля фитопатогенов и фитофагов; заведующий лабораторией фитопатологии цента биотехнологий

irina_astapchuk@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-7735-960X57191370976ABA-4739-20213835-6760ЯкубаГалина ВалентиновнаYakubaGalina V.
Россия

Ph.D. in Biology, Senior Researcher at the Laboratory of Biotechnological Control of Phytopathogens and Phytophages

канд. биол. наук, старший научный сотрудник лаборатории биотехнологического контроля фитопатогенов и фитофагов

galyayaku@gmail.comФедоровичСвятослав ВалерьевичFedorovichSvyatoslav V.
Россия

научный сотрудник центра молекулярно-генетических исследований

Research Associate at the Center for Molecular and Genetic Research

havok11.f@gmail.com58311310000ABE-2789-20221971-4994ЕлисютиковаАнастасия ВасильевнаYelisyutikovaAnastasia V.
Россия

лаборант центра молекулярно-генетических исследований

Laboratory Assistant at the Center for Molecular and Genetic Research

nas-elisyutikova@yandex.ruКузнецоваНадежда АлександровнаKuznetsovaNadezhda A.
Россия

лаборант лаборатории фитопатологии центра биотехнологий

Laboratory Technician at the Plant Pathology Laboratory of the Biotechnology Center

N9181102187n@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0002-4927-219256989221000K-9142-20175636-6106НасоновАндрей ИвановичNasonovAndrey I.
Россия

канд. биол. наук, заведующий лабораторией биотехнологического контроля фитопатогенов и фитофагов

Ph.D. in Biology, Head of the Laboratory for Biotechnological Control of Phytopathogens and Phytophages

nasoan@mail.ruФГБУН «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства и виноделия»North Caucasus Federal Scientific Center for Horticulture, Viticulture, and WinemakingФГБОУ ВО «Кубанский государственный аграрный университет имени И. Т. Трубилина»I. T. Trubilin Kuban State Agrarian Universityru28022026202618120722330072026Copyright ©; 2026, Astapchuk I.L., Yakuba G.V., Fedorovich S.V., Yelisyutikova A.V., Kuznetsova N.A., Nasonov A.I.Copyright ©; 2026, Астапчук И.Л., Якуба Г.В., Федорович С.В., Елисютикова А.В., Кузнецова Н.А., Насонов А.И.2026Astapchuk I.L., Yakuba G.V., Fedorovich S.V., Yelisyutikova A.V., Kuznetsova N.A., Nasonov A.I.Астапчук И.Л., Якуба Г.В., Федорович С.В., Елисютикова А.В., Кузнецова Н.А., Насонов А.И.https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0https://journals.rcsi.science/2658-6649/article/view/442828

As a result of route surveys of the gardens of the Krasnodar Territory, a rare species of Fusarium spp. was isolated in the root rot complex of apple trees. After assessing the morphological, cultural, and genetic characteristics of the monospore culture of the fungus, using the method of whole-genome sequencing, it was identified as Fusarium curvatum L. Lombard & Crous. The fact of parasitism was confirmed in accordance with Koch’s postulates.

В результате маршрутных обследований садов Краснодарского края, в патокомплексе корневой гнили яблони был выделен редкий вид Fusarium spp. Штамм был изучен на предмет морфолого-культуральных и генетических характеристик и был идентифицирован как Fusarium curvatum L. Lombard & Crous. Факт паразитирования подтверждён с соблюдением постулатов Коха.

domestic apple treeroot rotFusarium curvatumwhole-genome sequencingяблоня домашняякорневая гнильFusarium curvatumполногеномное секвенированиеAgafonova, V. A., & Popova, V. P. (2021). Prospects for the application of soil metagenomics methods to assess the quality of soils in garden cenoses. Fruit Growing and Viticulture of the South of Russia, 67, 203–225. https://doi.org/10.30679/2219-5335-2021-1-67-203-225. EDN: https://elibrary.ru/KRAQLMАгафонова, В. А., & Попова, В. П. (2021). Перспективы применения методов почвенной метагеномики для определения качества почв садовых ценозов. Плодоводство и виноградарство Юга России, 67, 203–225. https://doi.org/10.30679/2219-5335-2021-1-67-203-225. EDN: https://elibrary.ru/KRAQLMAlsaed, N., & Selitskaya, O. V. (2022). Features of the mycological component of the soil microbiome under monoculture and crop rotation. Natural and Technical Sciences, 7, 59–68. https://doi.org/10.25633/ETN.2022.07.02. EDN: https://elibrary.ru/ZJCHGMАльсаед, Н., & Селицкая, О. В. (2022). Особенности микологической компоненты микробиома почв при монокультуре и в севообороте. Естественные и технические науки, 7, 59–68. https://doi.org/10.25633/ETN.2022.07.02. EDN: https://elibrary.ru/ZJCHGMNur, A., Selitskaya, O. V., Pozdnyakov, L. A., Zavertkin, I. A., & Shubina, E. A. (2024). Assessment of the long-term impact of continuous cultivation of various agricultural crops on soil microbial communities. Izvestiya of Timiryazev Agricultural Academy, 2, 5–24. https://doi.org/10.26897/0021-342X-2024-2-5-24. EDN: https://elibrary.ru/DXVZVPНур, А., Селицкая, О. В., Поздняков, Л. А., Заверткин, И. А., & Шубина, Е. А. (2024). Оценка длительного воздействия бессменного выращивания различных сельскохозяйственных культур на микробные сообщества почвы. Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии, 2, 5–24. https://doi.org/10.26897/0021-342X-2024-2-5-24. EDN: https://elibrary.ru/DXVZVPVelibekova, L. A. (2023). Ways to strengthen Russia’s position in global production of fresh and processed fruit and berry products. In Modern trends and priorities for sustainable development of regions: Proceedings of the international scientific and practical conference dedicated to the 300th anniversary of the Russian Academy of Sciences (pp. 217–223). Dagestan Federal Research Center of the Russian Academy of Sciences.Велибекова, Л. А. (2023). Пути усиления позиций России в мировом производстве свежей и переработанной плодово-ягодной продукции. В Современные тренды и приоритеты устойчивого развития регионов: Материалы международной научно-практической конференции, посвященной 300-летию Российской академии наук (с. 217–223). Махачкала: Дагестанский федеральный исследовательский центр РАН.Zaynutdinov, Z. Z., & Aminova, E. V. (2024). The relationship between the quantity and quality of apple fruit yield and methods to improve them in the conditions of the South of European Russia. Subtropical and Ornamental Horticulture, 90, 46–54. https://doi.org/10.31360/2225-3068-2024-90-46-54. EDN: https://elibrary.ru/VLEXMVЗайнутдинов, З. З., & Аминова, Е. В. (2024). Взаимосвязь величины и качества урожая плодов яблони и приёмы их повышения в условиях Юга европейской России. Субтропическое и декоративное садоводство, 90, 46–54. https://doi.org/10.31360/2225-3068-2024-90-46-54. EDN: https://elibrary.ru/VLEXMVLitovka, Y. A., Chen, H., Li, W., & Pavlov, I. N. (2023). Fungi of the genus Fusarium associated with woody plants in Russia. Siberian Ecological Journal, 4, 547–563. https://doi.org/10.15372/SEJ20230411. EDN: https://elibrary.ru/PCLRDNЛитовка, Ю. А., Чен, Х., Ли, В., & Павлов, И. Н. (2023). Грибы рода Fusarium, ассоциированные с древесными растениями на территории России. Сибирский экологический журнал, 4, 547–563. https://doi.org/10.15372/SEJ20230411. EDN: https://elibrary.ru/PCLRDNMerezhko, O. E., & Aminova, E. V. (2023). Analysis of the modern assortment and dynamics of apple (Malus domestica Borkh.) cultivation in Russian horticulture. Bulletin of the Voronezh State Agrarian University, 16(3), 78. https://doi.org/10.53914/issn2071-2243_2023_3_94. EDN: https://elibrary.ru/RJQVIIМережко, О. Е., & Аминова, Е. В. (2023). Анализ современного сортимента и динамики выращивания яблони (Malus domestica Borkh.) в садоводстве России. Вестник Воронежского государственного аграрного университета, 16(3), 78. https://doi.org/10.53914/issn2071-2243_2023_3_94. EDN: https://elibrary.ru/RJQVIIOstapchuk, T. V., Khezhev, A. M., Sviridova, L. A., Dzhancharov, T. M., & Snegirev, D. V. (2023). Changes in the volumes of global apple production and international trade. International Agricultural Journal, 66(1), 33. https://doi.org/10.55186/25876740_2023_7_1_33. EDN: https://elibrary.ru/DHZUQUОстапчук, Т. В., Хежев, А. М., Свиридова, Л. А., Джанчаров, Т. М., & Снегирев, Д. В. (2023). Изменение объёмов глобального производства и международной торговли яблоками. International Agricultural Journal, 66(1), 33. https://doi.org/10.55186/25876740_2023_7_1_33. EDN: https://elibrary.ru/DHZUQUSutton, D., Fothergill, A., & Rinaldi, M. (2001). Identification of pathogenic and opportunistic fungi. Mir.Саттон, Д., Фотергил, А., & Ринальди, М. (2001). Определитель патогенных и условно-патогенных грибов. Москва: Мир.Chernikov, E. A., Astapchuk, I. L., Fedorovich, S. V., Popova, V. P., & Khudokormov, A. A. (2023). The effect of long-term orchard monoculture on the agrochemical and microbiological parameters of leached chernozems. Fruit Growing and Viticulture of the South of Russia, 82(4), 201–218. https://doi.org/10.30679/2219-5335-2023-4-82-201-218. EDN: https://elibrary.ru/TOZKUIЧерников, Е. А., Астапчук, И. Л., Федорович, С. В., Попова, В. П., & Худокормов, А. А. (2023). Влияние длительной монокультуры сада на агрохимические и микробиологические показатели чернозёмов выщелоченных. Плодоводство и виноградарство Юга России, 82(4), 201–218. https://doi.org/10.30679/2219-5335-2023-4-82-201-218. EDN: https://elibrary.ru/TOZKUIFedorovich, S. V., Astapchuk, I. L., Yakuba, G. V., & Nasonov, A. I. (2024). Identification of Fusarium sporotrichioides, the causative agent of root rot in domestic apple trees, and assessment of its toxigenicity and pathogenicity. Scientific Works of the North Caucasus Federal Scientific Center of Horticulture, Viticulture, and Winemaking, 38, 59–64. https://doi.org/10.30679/2587-9847-2024-38-59-64. EDN: https://elibrary.ru/RJEGSLФедорович, С. В., Астапчук, И. Л., Якуба, Г. В., & Насонов, А. И. (2024). Идентификация Fusarium sporotrichioides, возбудителя корневой гнили яблони домашней, и оценка его токсиногенности и патогенности. Научные труды Северо-Кавказского федерального научного центра садоводства, виноградарства, виноделия, 38, 59–64. https://doi.org/10.30679/2587-9847-2024-38-59-64. EDN: https://elibrary.ru/RJEGSLYarmeeva, M. M., Chudinova, E. M., Elanskaya, A. S., Kokaeva, L. Y., & Elansky, S. N. (2025). Fungi of the genus Fusarium on tomato plants in Russia. Mycology and Phytopathology, 59(2), 169–180. https://doi.org/10.31857/S0026364825020058. EDN: https://elibrary.ru/SQOXKYЯрмеева, М. М., Чудинова, Е. М., Еланская, А. С., Кокаева, Л. Ю., & Еланский, С. Н. (2025). Грибы рода Fusarium на растениях томата в России. Микология и фитопатология, 59(2), 169–180. https://doi.org/10.31857/S0026364825020058. EDN: https://elibrary.ru/SQOXKYAkgül, D. S., Önder, S., Savaş, N. G., Yıldız, M., Bülbül, İ., & Özarslandan, M. (2024). Molecular identification and pathogenicity of Fusarium species associated with wood canker, root and basal rot in Turkish grapevine nurseries. Journal of Fungi, 10(7), 444. https://doi.org/10.3390/jof10070444. EDN: https://elibrary.ru/NLMTZLCrous, P. W., Hernández-Restrepo, M., Van Iperen, A. L., Starink-Willemse, M., Sandoval-Denis, M., & Groenewald, J. Z. (2021). Citizen science project reveals novel fusarioid fungi (Nectriaceae, Sordariomycetes) from urban soils. Fungal Systematics and Evolution, 8(1), 101–127. https://doi.org/10.3114/fuse.2021.08.09. EDN: https://elibrary.ru/XKSGQUClaerbout, J., Van Poucke, K., Mestdagh, H., Delaere, I., Vandevelde, I., Venneman, S., & Höfte, M. (2023). Fusarium isolates from Belgium causing wilt in lettuce show genetic and pathogenic diversity. Plant Pathology, 72(3), 593–609. https://doi.org/10.1111/ppa.13668. EDN: https://elibrary.ru/AGVDFUDongzhen, F., Xilin, L., Xiaorong, C., Wenwu, Y., Yunlu, H., Yi, C., & Chunsheng, G. (1964). Fusarium species and Fusarium oxysporum species complex genotypes associated with yam wilt in South-Central China. Front Microbiol, 11, 1964. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01964. EDN: https://elibrary.ru/NYKNWIJang, Y., Yi, H., Maharjan, R., Jeong, M., & Yoon, Y. (2022). First report of root rot caused by Fusarium armeniacum on soybean in Korea. Plant Disease, 106(4), 1306. https://doi.org/10.1094/pdis-11-20-2319-pdn. EDN: https://elibrary.ru/VDZXUUJasarevic, M., Catalani, A., Morales-Rodríguez, C., Tatì, M., & Chilosi, G. (2022). First report of Fusarium brachygibbosum causing rots on potato tubers in Italy. Journal of Plant Pathology, 104(4), 1591–1591. https://doi.org/10.1007/s42161-022-01221-z. EDN: https://elibrary.ru/MHQOUAJoshi, N. A., & Fass, J. N. (2011). Sickle: A sliding-window, adaptive, quality-based trimming tool for FastQ files (Version 1.33).Lee, S. H., Shin, H., Lee, H. I., & Lee, S. (2022). The control efficacy of sodium hypochlorite against violet root rot caused by Helicobasidium mompa in apple. The Plant Pathology Journal, 38(5), 513–521. https://doi.org/10.5423/ppj.oa.04.2022.0057. EDN: https://elibrary.ru/KBKSHSLitovka, Y. A., Chen, H., Li, W., & Pavlov, I. N. (2023). Fusarioid fungi associated with woody plants in Russia. Contemporary Problems of Ecology, 16(4), 528–540. https://doi.org/10.1134/s1995425523040066. EDN: https://elibrary.ru/HZVYPWLombard, L., Sandoval-Denis, M., Lamprecht, S. C., & Crous, P. W. (2019). Epitypification of Fusarium oxysporum—clearing the taxonomic chaos. Persoonia—Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi, 43(1), 1–47. https://doi.org/10.3767/persoonia.2019.43.01. EDN: https://elibrary.ru/FIXTEXMa, K., Wang, Y., Wang, J., Zhang, Y., & Gao, J. (2023). First report of ginseng root rot caused by Fusarium subglutinans. Journal of General Plant Pathology, 89(5), 296–303. https://doi.org/10.1007/s10327-023-01136-2. EDN: https://elibrary.ru/JRPHOQMannai, S., Benfradj, N., & Boughalleb-M’Hamdi, N. (2024). Occurrence of Globisporangium and Phytopythium species associated with apple and peach seedlings decline in Tunisian nurseries. Journal of Plant Pathology, 106(2), 643–655. https://doi.org/10.1007/s42161-024-01600-8. EDN: https://elibrary.ru/KGEOIAMirghasempour, S. A., Michailides, T., Chen, W., & Mao, B. (2022). Fusarium spp. associated with Dendrobium officinale dieback disease in China. Journal of Fungi, 8(9), 919. https://doi.org/10.3390/jof8090919. EDN: https://elibrary.ru/FWPRJDMonteiro, R. C., Yu, M. C. Z., Dolatabadi, S., Hagen, F., Sandoval-Denis, M., Francisco, E. C., & Rodrigues, A. M. (2025). Molecular tracking of emerging Fusarium species in keratitis: F. veterinarium, F. contaminatum, and F. curvatum. Mycopathologia, 190(1), 22. https://doi.org/10.1007/s11046-025-00929-7. EDN: https://elibrary.ru/JKMYYANyoni, M., Mazzola, M., Wessels, J. P. B., & McLeod, A. (2021). Phosphonate treatment effects on Phytophthora root rot control, phosphite residues and Phytophthora cactorum inoculum in young apple orchards. Plant Disease, 105(12), 3835–3847. https://doi.org/10.1094/pdis-01-21-0067-re. EDN: https://elibrary.ru/FZUMIFPrice, M. N., Dehal, P. S., & Arkin, A. P. (2010). FastTree 2—approximately maximum-likelihood trees for large alignments. PloS One, 5(3), e9490. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009490. EDN: https://elibrary.ru/NYZTMLRomero-Arenas, O., Martínez-Salgado, S. J., Rivera, A., Huerta-Lara, M., Laug-García, B., & Villa-Ruano, N. (2022). First report of basal rot caused by Fusarium equiseti in onion crops from Puebla, Mexico. Tropical and Subtropical Agroecosystems, 25(2). https://doi.org/10.56369/tsaes.4210. EDN: https://elibrary.ru/KRPOVJSano, T., Mizuki, M., Matsui, K., Takahashi-Ando, N., Kimura, M., & Nakajima, Y. (2022). First report of Fusarium armeniacum isolated from rice in Aichi Prefecture. JSM Mycotoxins, 72(1), 1–3. https://doi.org/10.2520/myco.72-1-1. EDN: https://elibrary.ru/QMRESGSun, X., Jiang, S., Hong, H., Zhang, M., Xin, Z., Wu, B., & Xin, X. (2024). First report of fruit rot caused by Fusarium luffae in cherry tomato in China. Plant Disease, 108(3), 788. https://doi.org/10.1094/pdis-05-23-1019-pdn. EDN: https://elibrary.ru/KAKUEDVillanueva, O., & Ellouze, W. (2023). First report of a Canadian isolate of Phytopythium vexans causing root rot disease on apple and peach under laboratory conditions. New Disease Reports, 48(1). https://doi.org/10.1002/ndr2.12195. EDN: https://elibrary.ru/DQHXDAWaqas, M., Gilardi, G., Guarnaccia, V., & Spadaro, D. (2025). Host range and molecular characterization of the four races of Fusarium oxysporum f. sp. lactucae. Plant Disease. https://doi.org/10.1094/pdis-07-24-1505-re. EDN: https://elibrary.ru/KUUXPPZhou, Y., Zhang, W., Li, X., Ji, S., Chethana, K. W. T., Hyde, K. D., & Yan, J. (2022). Fusarium species associated with cherry leaf spot in China. Plants, 11(20), 2760. https://doi.org/10.3390/plants11202760. EDN: https://elibrary.ru/OLRAMV